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中國(guó)科學(xué)院合肥物質(zhì)科學(xué)研究院（Hefei Institute of Physical Science，Chinese Academy of Sciences）成立于2003年5月，可追溯至2001年11月由原中國(guó)科學(xué)院合肥分院及安徽光學(xué)精密機(jī)械研究所、等離子體物理研究所、固體物理研究所合并而成的中國(guó)科學(xué)院合肥研究院；2003年5月，正式批復(fù)合并為中國(guó)科學(xué)院合肥物質(zhì)科學(xué)研究院；2004年4月，合肥智能機(jī)械研究所劃歸該研究院。

中國(guó)科學(xué)院合肥物質(zhì)科學(xué)研究院的主要學(xué)科有等離子體物理與磁約束核聚變、強(qiáng)磁場(chǎng)科學(xué)與技術(shù)、材料物理與納米技術(shù)、大氣光學(xué)與遙感、環(huán)境光學(xué)與技術(shù)、仿生感知與智能系統(tǒng)、激光材料與技術(shù)、超導(dǎo)電工與節(jié)能應(yīng)用、離子束生物工程、智能農(nóng)業(yè)信息技術(shù)、太陽(yáng)能材料與工程等。 

截至2014年底，該研究院占地面積2.65平方公里，建有10個(gè)直屬研究所，1個(gè)國(guó)家工程中心，17個(gè)省部級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/工程中心；共有在職職工2408人，在學(xué)研究生1361人，在站博士后90余人。